Juanes zaczął grać na gitarze w wieku siedmiu lat. W 1988 roku wraz z grupą przyjaciół założył zespół Ekhymosis inspirowany muzyką Metalliki oraz innych ówczesnych zespołów metalowych. Grupa zyskała dużą popularność w Kolumbii i wydała w ciągu 10 lat pięć albumów. W 1998 roku zespół został rozwiązany, a Juanes rozpoczął karierę solową.

Pierwszy samodzielny album Fíjate Bien został wydany w 2000 roku i spotkał się z bardzo dobrym przyjęciem, przynosząc 3 nagrody Latin Grammy. Drugi album, Un Día Normal z 2002 roku, odniósł jeszcze większy sukces, zyskując status platynowej płyty i 5 nagród Latin Grammy. Piosenka z tego albumu "Mala Gente" została użyta w telenoweli produkcji meksykańskiej televisy "Velo de Novia" w Polsce znanej jako "Biały welon" Najnowsze wydawnictwo (z 2004), zatytułowane Mi Sangre, rozsławiła piosenka "La Camisa Negra". W tym roku Juanes wydał 4 płytę, zatytułowaną "La vida es un ratico" (Życie jest chwilą). Popularną piosenką z tego albumu jest "Me Enamora". .